MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY040

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016022	TCTGC	2	10	31	40	0 %	40 %	20 %	40 %	347626538
2	NC_016022	CGGT	2	8	119	126	0 %	25 %	50 %	25 %	347626538
3	NC_016022	TGA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626538
4	NC_016022	GGC	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626538
5	NC_016022	AGA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626538
6	NC_016022	ATC	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626538
7	NC_016022	ATC	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626538
8	NC_016022	TGA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626538
9	NC_016022	AAC	2	6	478	483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347626538
10	NC_016022	GCT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
11	NC_016022	TGT	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347626538
12	NC_016022	ATCA	2	8	543	550	50 %	25 %	0 %	25 %	347626538
13	NC_016022	CGT	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
14	NC_016022	GGT	2	6	649	654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347626538
15	NC_016022	TCG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626538
16	NC_016022	CGC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626538
17	NC_016022	CGA	2	6	839	844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626538
18	NC_016022	CGG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626538
19	NC_016022	TAA	3	9	880	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347626538
20	NC_016022	CA	3	6	895	900	50 %	0 %	0 %	50 %	347626539
21	NC_016022	TGA	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
22	NC_016022	ATC	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626539
23	NC_016022	CGC	2	6	1177	1182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626539
24	NC_016022	GTC	2	6	1205	1210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626539
25	NC_016022	ATGA	2	8	1247	1254	50 %	25 %	25 %	0 %	347626539
26	NC_016022	TGA	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
27	NC_016022	GGTCAA	2	12	1433	1444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347626539
28	NC_016022	TC	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	347626539
29	NC_016022	TG	3	6	1576	1581	0 %	50 %	50 %	0 %	347626539
30	NC_016022	CGG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626539
31	NC_016022	AAG	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626539
32	NC_016022	GTA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626539
33	NC_016022	CCG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626540
34	NC_016022	CG	3	6	3024	3029	0 %	0 %	50 %	50 %	347626540
35	NC_016022	GTC	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
36	NC_016022	CGT	2	6	3069	3074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
37	NC_016022	GCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
38	NC_016022	GCG	3	9	3402	3410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
39	NC_016022	GGC	2	6	3437	3442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
40	NC_016022	GAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
41	NC_016022	GCG	3	9	3534	3542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
42	NC_016022	CGG	2	6	3565	3570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
43	NC_016022	CGG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
44	NC_016022	TGA	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
45	NC_016022	ATC	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
46	NC_016022	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
47	NC_016022	GAC	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
48	NC_016022	CT	3	6	3810	3815	0 %	50 %	0 %	50 %	347626540
49	NC_016022	GCC	2	6	3834	3839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626540
50	NC_016022	CAT	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
51	NC_016022	TGC	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
52	NC_016022	ATCT	2	8	3968	3975	25 %	50 %	0 %	25 %	347626540
53	NC_016022	CAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
54	NC_016022	TCG	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
55	NC_016022	GAC	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
56	NC_016022	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347626540
57	NC_016022	CGAA	2	8	4134	4141	50 %	0 %	25 %	25 %	347626540
58	NC_016022	ATCC	2	8	4211	4218	25 %	25 %	0 %	50 %	347626540
59	NC_016022	AAG	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347626540
60	NC_016022	ATC	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
61	NC_016022	CGG	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347626540
62	NC_016022	GCGG	2	8	4333	4340	0 %	0 %	75 %	25 %	347626540
63	NC_016022	ATCGGC	2	12	4366	4377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347626540
64	NC_016022	CAT	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347626540
65	NC_016022	TGG	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347626540
66	NC_016022	TGA	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626540
67	NC_016022	TCG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347626540
68	NC_016022	CG	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	347626540
69	NC_016022	AGCGA	2	10	4648	4657	40 %	0 %	40 %	20 %	347626540

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.